因为Dojo拥有过于丰富的JavaScript类库，导致极其难以正确选择在工程中使用哪个类。没人有时间去详细分析每个类库，往往是依靠摸索其他人的意见，再做出确定的选择。不幸的是，有时候其他人说的并不符合实际要求，结果导致做出了错误的选择。
Dojo工具包的合作建立者——Dylan Schiemann，最近给出了一些他所看到的关于Dojo的错误：
Dojo没有文档化
Dojo速度慢
Dojo比Prototype, jQuery, MooTools, YUI等浮华，占用空间大，复杂。
Dojo需要Java
Dojo只对企业应用有用，而对小型网站或博客不起作用
Dojo只是个部件
Dojo不美观
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